生物蛋白質[1]的性質及其生理作用十分的復雜多樣，在實驗不斷向前探索的同時，理論化學方面針對生物大分子的研究也在不斷的發展。理論上研究蛋白質性質時，考慮局部殘基的性質對整個分子性質的影響是不可忽視的的。

本文使用原子 - 鍵電負性均衡方法 （ABEEMσπ），快速和準確計算出不同長度的蛋白質多肽殘基的電荷分布。為后來使用 ABEEMσπ 模型計算 Fukui 函數和整體軟度判斷大分子的整體反應活性，從而更好地應用蛋白質性質以及生理作用反應原理提供合理的參數體系。

1 計算方法和細節

1.1 計算方法

在密度泛函理論的基礎上，楊與合作者提出了原子 - 鍵電負性均衡方法（ABEEMsp），該模型將分子體系的單電子密度不僅劃分為原子區域，而且還有化學鍵區域 （ 包括 s 和 p 鍵 ） 和孤對電子區域。利用 ABEEMsp 方法，任意一個區域（i）的有效電負性可以表達為。

可以得到n+1個關于電荷和電負性為未知量的線性方程組。如果每一個位點的價態電負性*ic和價態硬度*ih已知，就可以快速的求出分子中的各個位點的電荷分布和分子的電負性。